La Charte de la Fédération a établi l’Académie de Starfleet la même année que la F.U.P.. Localisée à San Francisco, sur Terre, le campus combine esthétisme avec fonctionnalité. De nombreux centres de formation à travers la galaxie considèrent l’Académie de Starfleet comme leur modèle. Un cursus difficile de quatre années prépare les futurs officiers de Starfleet à leur carrière dans l’espace. L’Académie a pour devise : « Ex Astris, Scientia » qui signifie : « Des étoiles vient la connaissance ».
Des candidats potentiels de toutes parts de la Fédération concourent pour le petit nombre de places disponibles chaque année. Les citoyens ne faisant pas partie de la Fédération peuvent postuler s’ils reçoivent une recommandation de la part d’un officier de Starfleet de niveau commandement. Tous les candidats font face à un examen d’entrée rigoureux et à un ensemble de tests académiques, physiques et psychologiques. Ceux dont la candidature n’est pas acceptée peuvent se représenter par la suite.
Une fois accepté, un cadet doit faire face à un cursus strict et éreintant. Beaucoup de cadets se font recaler au cours de leur première année. L’Académie pousse les cadets jusqu’à leur limite, les exposant aux nombreux dangers auxquels ils auront à faire face dans le futur.
Au cours de la troisième année, un cadet peut postuler pour une division spécifique de Starfleet. La formation de la troisième et quatrième année donnent aux cadets les compétences exigées pour remplir leur devoir. Certaines divisions de Starfleet, comme les divisions médicales, d’ingénierie et scientifiques, demandent une formation plus poussée. Lorsqu’un cadet est diplômé de l’Académie de Starfleet, il reçoit son affectation et sa nomination d’enseigne.